1. buka ssh masuk ke server.
2. ketikan nano /etc/phpMyAdmin/config.inc.php
3. tambah baris berikut di bagian akhir $cfg['ExecTimeLimit'] = 0;
4. save.
Setelah itu anda bisa import database ukuran besar, namun saya sarankan jika proses import selesai silahkan hapus kode $cfg['ExecTimeLimit'] = 0; karena jika di biarkan akan membebani server.